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基因测序的原理(基因测序概念股票)

2023-05-07 15:50分类:投资学习 阅读:

近10年来,肠道微生物基因组成为生命科学研究领域的热点。然而,目前大部分相关研究,仍使用主流二代测序技术进行肠道微生物种功能解析,宏基因组的拼接质量仍然有较大提高空间,且菌株水平的功能差异分析等领域亟待新的突破。

不久前,我国首部生物经济的五年规划《“十四五”生物经济发展规划》发布。该规划明确指出,加快发展高通量基因测序技术,推动以单分子测序为标志的新一代测序技术创新。而近期,三代测序技术已引发整个行业的关注,不少企业正积极布局,将其作为二代测序技术的有效补充,在针对二代测序范围外的复杂基因突变类型进行测序方面寻求新的解决方案。

高扬:

近5日资金流向一览见下表:

今年1月,我们与PacBio开始联合研发三代桌面测序仪。为什么要做这件事?因为中国的临床市场是多层次的,要用硬件、用适宜的试剂盒来满足多层次需求。我们经过调研得到一个结论:广大临床市场只需测序仪满足某几个固定方面的应用。比如,三代测序仪在临床主要是针对结构复杂的变异等,对测序量要求不大,但对测序质量、数据解读的直观性要求较高。另外,中国广大医院对于基因病的诊断能力依然在提高中,对桌面型测序仪有比较大的需求。等到三代桌面测序仪研发成功,会率先在中国市场以国产化的形式上市。

就监管政策而言,我觉得应该给这些科技属性的创新企业更宽松的环境。在对企业临床试验标准严格的基础上,给予企业在技术上、政策上甚至资金、上市等方面一定支持。

近期,我国首部生物经济五年规划——《“十四五”生物经济发展规划》发布,这标志着生物经济成为了一种全新的经济形态。《规划》指出,要开展前沿生物技术创新,加快发展高通量基因测序技术,推动以单分子测序为标志的新一代测序技术创新,明确鼓励探索第三代测序技术,将其作为有效补充,为二代测序范围外的复杂基因突变类型寻求新的解决方案。

三代测序是贝瑞基因布局的重点,在这个领域贝瑞基因非常有前瞻性,早在2019年就宣布与美国知名三代测序企业PacBio太平洋生物科技就第三代测序仪的开发及临床推广达成长期合作,双方联合开发第三代测序平台。那么高董您认为,贝瑞基因是因循怎样的思路和规划在布局三代测序,未来临床转化的发力点又是什么?

我们投资领域确实非常关注三代基因测序,未来也会有更多的资本涌入这个赛道。从二级市场维度来看,我认为测序板块具有很强的成长性,是一个长坡厚雪的赛道。这个赛道的成长性主要来自两点,首先它具有宽广的边界,这决定了其有一个长期较大的发展空间;第二它属于密集创新,决定了它有较高的成长性和丰富的业态。未来一级市场也会有一大批测序项目涌进来,那时这个赛道会获得更高的关注度和资金支持。

其实一代测序在临床应用上仍然很多。比如一代测序过程细致,质控环节多,不容易污染,测序结果也很直观。如果对二代测序结果有疑问,很多时候还会跟一代测序结果去比对。一代测序在某一些场景下还是金标准。但是一代测序,有一个非常大的问题,就是耗时长、成本高,所以,后来二代测序慢慢崛起。第二代基因测序技术逐步走入大众视野,第二代基因测序技术以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa、Hiseq技术和ABI公司的SOLiD技术为代表。第二代测序法首先要将DNA随机切割成小片段,然后在这些小片段分子的两端连接上接头(adapter)制成DNA测序文库。

与第一代测序仪的区别在于,第二代测序仪采用的是合成测序法,即边合成边测序,在通过聚合酶或连接酶不断地延伸引物获得模板序列的同时,对每一轮反应的结果进行荧光图像采集、分析,最后获得全序列的测序结果。测试速度快,成本低,并且保持了高准确性。当然二代测序仪也有其缺点,由于其将DNA切割成小片段后扩增读取的技术路线,测序的读长较短,而且在扩增过程中也会给测序带来各种误差。

第三代测序技术是指单分子测序技术。DNA测序时,不需要经过PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序。第三代测序技术也叫从头测序技术,即单分子实时DNA测序。第三代测序技术原理主要分为两大技术阵营:

第一大阵营是单分子荧光测序,代表性的技术为美国螺旋生物(Helicos)的SMS技术和美国太平洋生物(Pacific Bioscience)的SMRT技术。

第二大阵营为纳米孔测序,代表性的公司为英国牛津纳米孔公司。

临床实践表明,三代测序可以提供一个更高的卫生经济学结果。就以贝瑞基因正在推进的第三代地中海贫血病基因检测为例,这是国内首个基于三代测序技术在临床应用的检测产品,到目前为止,我们的临床测试显示,检出率几乎是100%,有很多一代或者二代都无法检测到的变异,都是三代测序检测出来的。

PacBio从2019年推出高保真测序技术之后,我们的业务中心逐渐从传统的纯科研,特别是动植物领域转向人类医学健康领域。我认为,PacBio还有很多非常有价值的事情可以做。第一,现在人类基因组的相当多的参考基组或者各种数据、模型,基本上都还是建立在ngs二代测序的基础上的,随着完整人类参考基因组的建立,现在有很多类似于叫泛基因组,就是我们称作为疾病相关数据库的更新,会让我们下游的临床应用更加精准。第二,我觉得可以更多的参与到人类基因临床科研以及健康诊断行业中来,与贝瑞基因深度合作,能够让技术更快地应用到临床中。

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